Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUPL2O15504 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUPL2O15504 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms