Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD3EAPO15446 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms