Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA5O15230 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms