Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBDO15205 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBDO15205 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBDO15205 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBDO15205 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBDO15205 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBDO15205 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBDO15205 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBDO15205 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBDO15205 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBDO15205 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBDO15205 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBDO15205 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBDO15205 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBDO15205 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBDO15205 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBDO15205 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBDO15205 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBDO15205 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms