Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms