Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNMO15061 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SYNMO15061 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNMO15061 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNMO15061 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNMO15061 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNMO15061 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNMO15061 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNMO15061 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNMO15061 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNMO15061 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNMO15061 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNMO15061 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNMO15061 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNMO15061 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNMO15061 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNMO15061 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNMO15061 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNMO15061 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNMO15061 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYNMO15061 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYNMO15061 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SYNMO15061 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNMO15061 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNMO15061 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNMO15061 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNMO15061 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNMO15061 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNMO15061 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNMO15061 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms