Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms