Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FFAR3O14843 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms