Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM38O00635 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM38O00635 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms