Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ELL2O00472 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ELL2O00472 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ELL2O00472 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ELL2O00472 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ELL2O00472 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ELL2O00472 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ELL2O00472 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ELL2O00472 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ELL2O00472 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ELL2O00472 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ELL2O00472 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ELL2O00472 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ELL2O00472 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ELL2O00472 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ELL2O00472 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ELL2O00472 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ELL2O00472 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ELL2O00472 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ELL2O00472 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ELL2O00472 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ELL2O00472 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELL2O00472 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELL2O00472 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ELL2O00472 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELL2O00472 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ELL2O00472 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ELL2O00472 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ELL2O00472 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ELL2O00472 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ELL2O00472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ELL2O00472 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELL2O00472 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELL2O00472 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELL2O00472 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELL2O00472 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ELL2O00472 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ELL2O00472 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ELL2O00472 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ELL2O00472 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ELL2O00472 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ELL2O00472 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms