Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFRA2O00451 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms