Protein–RNA interactions for Protein: O00418

EEF2K, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF2KO00418 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF2KO00418 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF2KO00418 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms