Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD12O00232 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms