Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC188H7C350 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC188H7C350 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms