Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms