Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C6orf229H3BNL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms