Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8VRH5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8VRH5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8VRH5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8VRH5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8VRH5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F8VRH5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F8VRH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F8VRH5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F8VRH5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms