Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L20D6RJB6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L20D6RJB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L20D6RJB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms