Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DEV8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DEV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DEV8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DEV8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DEV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DEV8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DEV8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DEV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DEV8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DEV8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4DEV8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4DEV8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms