Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM114B3SHH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms