Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms