Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PP2D1A8MPX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PP2D1A8MPX8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms