Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3P2A8K0S8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms