Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms