Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49BA6NDI0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49BA6NDI0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms