Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms