Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms