Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC189A1A4V9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms