Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms