Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms