Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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