Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms