Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms