Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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