Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms