Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms