Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIRT1Q96EB6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms