Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms