Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE1Q8WV22 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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