Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms