Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBA3Q8TBC4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBA3Q8TBC4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA3Q8TBC4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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