Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms