Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms