Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT2Q7Z6L0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms