Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP45Q70EL2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP45Q70EL2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP45Q70EL2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP45Q70EL2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP45Q70EL2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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