Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DENND5BQ6ZUT9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DENND5BQ6ZUT9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms