Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms