Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HRCT1Q6UXD1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms