Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms