Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms